Léon Provancher possède l'une des plus importantes bibliothèques scientifiques privées au pays, avec ses 500 volumes. Sa correspondance avec de nombreux naturalistes lui fournit aussi le moyen de l'enrichir. Il achète ses livres au Québec mais également par le biais de libraires européens et américains.

Il profite également du fait que certains musées distribuent gratuitement leurs publications scientifiques à quelques correspondants privilégiés. Par ailleurs, lors de ses nombreux voyages, il ramène les ouvrages spécialisés qui lui sont nécessaires. De plus, certains musées lui échangent leurs publications scientifiques en retour du Naturaliste canadien .

Après avoir été intégrés à la bibliothèque du parlement de Québec, ses livres sont maintenant conservés à l'Université Laval. Ils démontrent la polyvalence du naturaliste et sa capacité à trouver des informations scientifiques de qualité, malgré son isolement.